Кобато, который когда-то получил горький опыт в дедукции, известной как "работа мудрости", был полон решимости стать честным и скромным гражданином. Он тайно подружился со своей одноклассницей Юки Осанай, которая разделяла его устремления, планируя дебютировать в старшей школе как обычные граждане и вести мирную жизнь. Однако по какой-то причине в их школьной жизни одно за другим происходят загадочные происшествия и несчастья. Смогут ли Кобато и Осанай прожить мирные дни как обычные граждане?